Les héroïnes du roman sont six écolières, unies dans le "clan Brody" par la volonté de leur professeur bien-aimé, Mlle Gene Brody. L'action se déroule à Edimbourg dans les années trente. Mlle Brodie dirige une classe d'école primaire pour petites filles dans une école privée respectable. Lors d'une des premières leçons de l'histoire, Miss Brody raconte au lieu d'une conférence le complot tragique de son premier amour - son fiancé est mort à la guerre une semaine avant la trêve - qui touche les filles aux larmes. Ainsi commence ses cours de «Vérité, bien et beauté», en utilisant les méthodes les moins conventionnelles. Se livrant à l'éducation des enfants, elle leur a donné, dans sa propre expression préférée, "les fruits de son heure de gloire".
Mlle Brodie, à son apogée, malgré des méthodes non conventionnelles, n'était pas du tout un événement exceptionnel, ou pas tout à fait dans son esprit. Son caractère unique consistait uniquement dans le fait qu'elle enseignait dans un établissement d'enseignement aussi conservateur. Dans les années trente, comme Mlle Brody, il y avait des légions: des femmes de trente ans et plus qui remplissaient leur vie ancienne de guerre sans ressources par une activité vigoureuse dans les domaines de l'art et du bien-être social, de l'illumination et de la religion. Certaines étaient féministes et promouvaient les idées les plus avancées, d'autres se limitaient à la participation aux comités de femmes et aux réunions d'église. Cependant, les femmes de la première catégorie n'enseignaient pas, bien sûr, dans les écoles conservatrices, là elles n'avaient pas de place. C'est ce que les collègues de Mlle Brodie ont pensé. Mais Mlle Brody, entourée de ses élèves choisis, le clan Brody, est restée inaccessible à l'intrigue. "Inébranlable, comme un rocher", admirent ses admirateurs en marchant fièrement le long du couloir de l'école aux salutations dédaigneuses de ses collègues plus ordinaires.
Mlle Brodie semble extraordinaire, du moins en milieu scolaire. Elle n'est pas belle et pas du tout jeune, mais au moment de «son apogée», elle éprouve des éclairs de charme authentique, et dans de tels moments, elle est exceptionnellement bonne. Elle est également extrêmement attrayante pour les hommes et gagne le cœur des deux seuls enseignants masculins à l'école.
Avec l'âge d'or de Mlle Brody, les premières étapes d'une incroyable évolution spirituelle ont lieu, changeant intérieurement et extérieurement aussi rapidement que ses élèves en pleine croissance. Alors que les filles étudient toujours sous sa supervision dans les classes élémentaires, Mlle Brody transforme les cours de mathématiques, d'anglais ou d'histoire en excursions particulières dans tous les domaines de la culture humaine, de l'érotisme au fascisme: sa nature artistique passionnée, qui ne connaît aucune interdiction religieuse, adore les deux, et pendant ce temps, Giotto et Mary Stuart.
Progressivement, imperceptiblement pour elle-même, une croyance risquée en sa propre impeccabilité grandit en elle; à son apogée, elle transcende les frontières de toute éthique et atteint un degré d'immoralité vraiment choquant.
Mais jusqu'à présent, son influence sur le clan Brody est illimitée. Il se compose de six filles: Monica Douglas, connue pour ses capacités mathématiques et ses explosions de colère, athlétique Eunice Gardner, gracieuse Jenny Gray, Mary McGregor à l'esprit lent, Sandy Stanger avec des yeux de cochon inhabituellement minuscules et par la suite célèbre pour son sex-appeal Rose Stanley. Ils grandissent sous la puissante influence spirituelle de Miss Brody, leur vie intérieure est entièrement remplie d'une analyse des observations de leur professeur. Un jour, lors d'une excursion, Mlle Brody explique aux filles ce que signifie en fait lui enseigner. Éduquant les enfants, elle met en évidence les qualités inhérentes à eux par nature, mais elle est également tenue d'investir dans les informations des enfants qui leur sont étrangères. Elle convainc le «clan» que, en grandissant, chaque fille doit trouver et réaliser «sa vocation», comme elle l'a trouvée en eux.
Mlle Brodie se dirige vers l'apogée de son apogée; les filles grandissent et se développent avec elle. Il lui semble que personne mieux qu'elle ne peut deviner la véritable vocation des enfants et fait des efforts effrénés pour guider les filles sur la seule bonne voie, il lui semble.
Chacun des «clans Brody» vit un destin individuel et unique, complètement différent des vocations conçues par Miss Brody. Son rôle posthume dans leur vie d'adulte est beaucoup plus subtil et plus complexe.
Plus tragique que les autres, Mary McGregor, une imbécile sans contrepartie pour les amis et Mlle Brody. Elle décède à vingt-trois ans dans un hôtel en flammes et peu de temps avant sa mort, dans un moment triste, décide que les moments les plus heureux de sa courte vie ont été ceux qu'elle a passés en compagnie de Mlle Brody et de son «clan», quoique sur une base de réflexion lente. Toutes les filles à leur manière trahissent les idéaux de Miss Brody. Peu de temps avant la mort d'un cancer, leur mentor survit enfin à l'école sous prétexte de prêcher le fascisme aux enfants. Mlle Brodie, en fait, admirait presque naïvement l'ordre et la discipline dans les pays fascistes ainsi que les monuments et les fontaines. Et maintenant Sandy Stanger, sa confidente, déjà sur le point d'obtenir son diplôme, incite le réalisateur, le principal malfaiteur de Mlle Brody, à trouver à redire aux convictions politiques et à forcer Mlle Brody à démissionner. Sandy va de la manière la plus difficile et la plus contradictoire. La trahison de sa laisse croire que les activités de Mlle Brody sont finalement préjudiciables à ses favoris. Le fait est que Mlle Brody tombe amoureuse d'un professeur de dessin, Teddy Lloyd, un grand catholique. Réalisant que cet amour n'est pas réalisable, elle, comme pour se contrarier, entre en relation avec Gordon Loiter, professeur de musique. Cependant, aimant Teddy, elle pense qu'une des filles devrait la remplacer et devenir sa maîtresse. Elle met son cœur et son âme dans ce plan sauvage, selon lequel Rose Stanley, la plus féminine des filles, devrait plutôt se rendre à l'artiste. Cependant, Rose est complètement indifférente à Teddy, et Sandy devient sa maîtresse. Dans le même temps, Miss Brody était et reste la véritable muse de l'artiste, et avec stupéfaction Sandy voit que peu importe laquelle des filles du "clan" Teddy dessine, les traits de Miss Brody sont toujours apparus en elle. Sandy, possédant l’esprit froid et analysant du psychologue, ne peut accepter le mystère de l’influence mystérieuse et puissante de la «vieille fille drôle» sur tout le monde. Il s’avère rapidement qu’une des fans de Mlle Brodie, qui n’appartient pas au «clan», succombe à son agitation et s’échappe en Espagne pour combattre aux côtés du fasciste Franco. Elle meurt en chemin dans le train. Puis, horrifiée, Sandy donne à Mlle Brody le directeur, et elle fait allusion à Mlle Brody. L'idée de trahison sape l'esprit indomptable de Mlle Brody. Jusqu'à sa mort, elle ne cesse de se tourmenter elle-même et les autres avec une spéculation stérile. En fait, semble-t-il à Sandy, l'ensemble du «clan» trahit Miss Brody, renonçant aux «appels». Mlle Brody a vu dans ses filles «l'instinct et la perspicacité», digne d'une vie pleine et vibrante. Sandy, après la trahison, part pour le monastère, où elle est malheureuse et déçue. Rose Stanley devient une épouse vertueuse, bien qu'elle ait une nouvelle Vénus, «une grande amante», selon Mlle Brody. Mais ils sentent tous qu'ils se sont trompés.
Au cours des années d'amitié avec Miss Brody, ils sont tellement imprégnés de sa foi qu'ils acquièrent une ressemblance spirituelle intérieure avec elle, que l'artiste Teddy Lloyd a correctement capturée dans ses peintures.